飛控系統又稱飛行控制系統，通過高效的控制算法內核，能夠精準地感應并計算出飛行器的飛行姿態等數據，再通過主控制單元實現精準定位懸停和自主平穩飛行。
在沒有飛行控制系統的情況下，有很多的專業飛手經過長期艱苦的練習，也能控制飛行器非常平穩地飛行，但是，這個難度和要求特別高，同時需要非常豐富的實戰經驗。
如果沒有飛行控制系統，飛手需要時時刻刻關注飛行器的動向，眼睛完全不可能離開飛行器，時時刻刻處于高度緊張的工作狀態。而且，人眼的有效視距是非常有限的，即使能穩定地控制飛行，但是控制的精度也很可能滿足不了航拍的需求，控制距離越遠，控制精度越差。還有，對于不同的拍攝需求，以及面臨不同的拍攝環境或條件，人為飛行控制更是難上加難，甚至根本不可能實現。飛行控制系統是目前實現多旋翼無人飛行器簡單操控和精準飛行的必備條件。
飛行控制系統一般主要由主控單元、IMU（慣性測量單元）、GPS指南針模塊、LED指示燈模塊、PMU（電源管理模塊）、IOSD數據記憶模塊等部件組成。IMU是角速度以及加速度傳感器，對飛行器的運動姿態進行偵測并反饋給主控。磁羅盤（指南針）是飛行器方向傳感器，對飛行器的方向位置進行偵測并反饋給主控。主控正是在獲得角速度、加速度、方向等姿態信息后，才能夠對數據進行分析并Z終保持了自身的平衡。而GPS是全球定位系統，能夠確定飛行器所處的經緯度，Z終保障飛行器能夠實現定點懸停以及自動航線飛行。
